報告題目：3D genome regulation in development and diseases

報 告 人：李 程  教 授

報告時間：2024年12月4日（星期三），上午9:30

報告地點：生科院1號樓109會議室

主辦單位：生命科學學院、江蘇省比較基因組學重點實驗室、江蘇省基因組學國際聯(lián)合研究中心、科學技術(shù)研究院

報告人簡介：

　　李程教授/博士生導(dǎo)師，國家杰出青年科學基金獲得者，任職于北京大學生命科學學院，北京大學統(tǒng)計科學中心及北京大學生物信息中心。1995年本科畢業(yè)于北京師范大學數(shù)學系，2001年博士畢業(yè)于美國加州大學洛杉磯分校統(tǒng)計系。2002至2013年在哈佛大學生物統(tǒng)計系暨Dana-Farber 癌癥研究所先后擔任助理教授和副教授。2013年起在北京大學任職。現(xiàn)擔任中國遺傳學會三維基因組學專委會、中國生物信息學基因組信息學專委會副主任委員。實驗室使用和發(fā)展組學新技術(shù)，以研究大腦衰老和再生過程的機制和干預(yù)方法。采用高通量實驗技術(shù)和計算方法相結(jié)合的手段，系統(tǒng)開展了細胞命運調(diào)控的三維基因組與多組學研究。發(fā)現(xiàn)了加速干細胞重編程和治療難治性腫瘤的新靶點，為三維基因組學發(fā)展了新技術(shù)，為染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)參與細胞命運調(diào)控研究開拓了新視角。研究組開發(fā)的dChip（生物芯片分析）、ComBat（批次效應(yīng)矯正）等基因組數(shù)據(jù)分析算法和軟件被同行廣泛使用，發(fā)表學術(shù)論文150余篇，包括作為通訊作者發(fā)表在Cell、Cell Stem Cell、Cancer Cell、Nature Immunology的論文，谷歌學術(shù)累計引用48,000次，h-index為79。研究組獲得國家自然科學基金委員會杰出青年科學基金項目、基礎(chǔ)科學中心項目、科技部重點研發(fā)計劃的資助。研究組介紹網(wǎng)頁：http://3d-genome.life/。

報告摘要：

　　三維基因組學是一個新興的表觀遺傳學研究方向，其研究重點在于理解基因組的空間組織結(jié)構(gòu)以及這種結(jié)構(gòu)如何影響基因表達和調(diào)控。在真核生物中，基因組不是以線性形式存在，而是以復(fù)雜的三維空間結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)。這種三維結(jié)構(gòu)主要由染色質(zhì)纖維通過各種相互作用形成，包括染色質(zhì)環(huán)、拓撲結(jié)構(gòu)域、AB區(qū)室、染色質(zhì)互作樞紐等。在本報告中，將首先介紹基于高通量測序的方法，如Hi-C，這些方法能夠提供高分辨率數(shù)據(jù)，在全基因組范圍揭示染色質(zhì)空間互作網(wǎng)絡(luò)和動態(tài)。染色質(zhì)互作的異常變化與多種疾病相關(guān)，如癌癥、神經(jīng)退行性疾病等。因此，研究染色質(zhì)互作的機制和功能，有助于我們理解疾病的發(fā)病機制，并開發(fā)出新的治療方法。